ในสถานพยาบาล น้ำบริสุทธิ์พิเศษมีบทบาทสำคัญในหลายด้าน รวมถึงการทำงานของอุปกรณ์ทางการแพทย์ (เครื่องฟอกเลือด, อุปกรณ์ทำความสะอาดในศูนย์จ่ายอุปกรณ์ทำความสะอาด, อุปกรณ์ถ่ายภาพ), การทดสอบและวิเคราะห์ (การวิเคราะห์ทางชีวเคมี, การเพาะเลี้ยงจุลินทรีย์) และการผลิตสูตร (สารละลายทางหลอดเลือดดำปริมาณมาก, สูตรเฉพาะที่) โรงพยาบาลมีข้อกำหนดด้านคุณภาพที่เข้มงวดอย่างยิ่งสำหรับน้ำบริสุทธิ์พิเศษ ซึ่งโดยทั่วไปจะต้องเป็นไปตามมาตรฐานเภสัชตำรับที่เกี่ยวข้อง (เช่น เภสัชตำรับของจีน) และกฎระเบียบของอุตสาหกรรม (ตัวบ่งชี้จุลินทรีย์, ตัวบ่งชี้เอนโดทอกซิน, ตัวบ่งชี้ทางเคมี)
น้ำดิบ → ปั๊มแรงดันน้ำดิบ → ตัวกรองมัลติมีเดีย → ตัวกรองคาร์บอนกัมมันต์ → เครื่องทำน้ำอ่อน → ตัวกรองความแม่นยำ → RO หลัก → การปรับค่า pH → ถังเก็บน้ำกลาง → RO รอง → ถังเก็บน้ำกลาง → ปั๊มน้ำกลาง → ระบบ EDI → ถังเก็บน้ำบริสุทธิ์ → ปั๊มน้ำบริสุทธิ์ → เครื่องฆ่าเชื้อ UV → ตัวกรองไมโครพอร์ → การพาสเจอร์ไรซ์ → จุดจ่ายน้ำ